refactor(genome): restructure as skill + prompt verbund

- Skill: .github/skills/genome/ (SKILL.md + genome-extract.py)
- Router: .github/prompts/genome.prompt.md (orchestriert alle 3 Phasen)
- Sub-Prompts: genome-distill.prompt.md, genome-propagate.prompt.md
- Output: .github/genome/output/ (gitignored)

Aufruf: /genome → fragt Quell-Repo + Zeitspanne, führt
Extraction → Distillation → Propagation durch.

.github/genome/output/.gitkeep

@@ -0,0 +1,6 @@
+# Genome Engine Output
+
+Generierte Dateien (nicht committen):
+- `raw-mutations.md`
+- `distilled-mutations.md`
+- `propagation-proposals.md`

.github/prompts/genome.prompt.md

@@ -0,0 +1,83 @@
+---
+description: "Genome Engine – Erkennt evolutionäre Verbesserungen an Copilot-Customization-Dateien und überträgt sie auf ein Ziel-Repo."
+agent: agent
+model: Claude Sonnet 4.6 (copilot)
+tools: [read, edit, search, execute]
+---
+
+# Genome Engine
+
+> **Skill-Referenz:** Lies `.github/skills/genome/SKILL.md` für das vollständige Konzept.
+
+Du orchestrierst die 3 Phasen der Genome Engine: **Extraction → Distillation → Propagation**.
+
+## Parameter ermitteln
+
+Frage den User (falls nicht angegeben):
+
+1. **Quell-Repo** – Pfad zum Repository mit den Verbesserungen (Default: aktuelles Repo)
+2. **Zeitspanne** – Seit wann nach Mutations suchen (Default: "7 days ago")
+3. **Ziel-Repo** – Pfad zum Repo, das die Verbesserungen erhalten soll (Default: aktuelles Repo)
+
+> Wenn Quell- und Ziel-Repo identisch sind: Extraction + Distillation durchführen, aber Propagation überspringen (sinnlos auf sich selbst).
+
+## Phase 1: Extraction
+
+Führe das Extraction-Script aus:
+
+```bash
+python .github/skills/genome/genome-extract.py --since "<zeitspanne>" --repo "<quell-repo>" --output ".github/genome/output/raw-mutations.md"
+```
+
+Prüfe das Ergebnis:
+- Wenn 0 Traits gefunden: Melde "Keine Mutations im Zeitraum" und stoppe.
+- Sonst: Zeige kurze Zusammenfassung (Anzahl Traits, Anzahl Mutations) und weiter zu Phase 2.
+
+## Phase 2: Distillation
+
+Führe jetzt die Distillation durch. Folge den Anweisungen aus `.github/prompts/genome-distill.prompt.md`:
+
+1. Lies `.github/genome/output/raw-mutations.md`
+2. Klassifiziere jede Mutation (🔴 Critical / 🟡 Evolution / ⚪ Specialized)
+3. Score den Übertragungswert (1–10)
+4. Sanitize sensitive Daten
+5. Filtere Specialized + Score < 4
+6. Schreibe `.github/genome/output/distilled-mutations.md`
+
+Zeige dem User eine Zusammenfassung:
+```
+Distillation: X Critical, Y Evolution (Z Specialized entfernt)
+```
+
+Wenn 0 Critical + 0 Evolution übrig: Melde "Keine übertragbaren Mutations" und stoppe.
+
+## Phase 3: Propagation
+
+> **Nur wenn Quell-Repo ≠ Ziel-Repo.**
+
+Führe die Propagation durch. Folge den Anweisungen aus `.github/prompts/genome-propagate.prompt.md`:
+
+1. Lies `.github/genome/output/distilled-mutations.md`
+2. Scanne das Ziel-Genome (`.github/` des Ziel-Repos)
+3. Matche Traits und generiere Patches
+4. Zeige die Checkliste:
+   - `[x]` Critical (default an)
+   - `[x]` Evolution mit Score ≥ 7 (default an)
+   - `[ ]` Evolution mit Score < 7 (default aus)
+
+Frage den User:
+> **Welche Vorschläge soll ich anwenden?** (Nummern, "alle", "critical+evolution≥7", oder "keine")
+
+Wende die ausgewählten Patches an.
+
+## Abschluss
+
+Zeige eine Zusammenfassung:
+```
+Genome Engine abgeschlossen:
+  Quell-Repo:  <name>
+  Zeitraum:    <since>
+  Extrahiert:  X Traits, Y Mutations
+  Destilliert: A Critical, B Evolution
+  Angewendet:  N Patches
+```

.github/skills/genome/SKILL.md

@@ -0,0 +1,61 @@
+# Genome Engine
+
+Automatische Erkennung und Übertragung evolutionärer Verbesserungen an Copilot-Customization-Dateien (Skills, Agents, Prompts, Instructions) zwischen Repositories.
+
+## Trigger-Phrasen
+
+`genome`, `propagate`, `mutations übertragen`, `traits synchronisieren`, `genome extract`, `genome propagate`
+
+## Konzept
+
+Die Genome Engine erkennt Verbesserungen an Copilot-Konfigurationsdateien über Git-History, destilliert sie in übertragbare "Growth Vectors" und schlägt konkrete Patches für andere Repos vor.
+
+**Begriffe:**
+- **Trait** – Ein Skill, Agent, Prompt(-Verbund) oder Instructions-File
+- **Genome** – Die Gesamtheit aller Traits eines Projekts
+- **Mutation** – Ein Git-Commit-Delta an einem Trait
+- **Growth Vector** – Destillierte, bewertete Mutation (bereinigt, klassifiziert, gescored)
+- **Propagation** – Konkreter Änderungsvorschlag für ein Ziel-Genome
+
+## Pipeline
+
+| Phase | Tool | Input → Output |
+|-------|------|----------------|
+| 1. Extraction | `genome-extract.py` | Git-History → `raw-mutations.md` |
+| 2. Distillation | `genome-distill.prompt.md` | `raw-mutations.md` → `distilled-mutations.md` |
+| 3. Propagation | `genome-propagate.prompt.md` | `distilled-mutations.md` + Ziel-Genome → Patches |
+
+## Usage
+
+```
+/genome
+```
+
+Der Router-Prompt fragt nach Quell-Repo und Zeitspanne, dann orchestriert er alle 3 Phasen.
+
+## Dateien
+
+| Datei | Zweck |
+|-------|-------|
+| `SKILL.md` | Diese Dokumentation |
+| `genome-extract.py` | Phase 1: Git-Scanning + Trait-Erkennung |
+
+## Trait-Erkennung
+
+Pfade werden automatisch zu Trait-Keys aufgelöst:
+
+```
+.github/skills/gh-tickets/SKILL.md      → skill/gh-tickets
+.github/agents/code-reviewer.agent.md   → agent/code-reviewer
+.github/prompts/nextstep.prompt.md       → prompt/nextstep  (inkl. Sub-Prompts)
+.github/copilot-instructions.md          → instructions/copilot-instructions
+```
+
+## Genome-Scope
+
+Folgende Pfade bilden das Genome:
+- `.github/skills/**`
+- `.github/agents/**`
+- `.github/prompts/**`
+- `.github/copilot-instructions.md`
+- `.github/*.instructions.md`

.github/skills/genome/genome-extract.py

@@ -7,8 +7,8 @@ Scannt git log für Änderungen im Genome-Scope (.github/skills, agents, prompts
 Gruppiert Diffs nach Trait und gibt strukturiertes Markdown aus.
 
 Usage:
-    python .github/genome/genome-extract.py --since "7 days ago"
-    python .github/genome/genome-extract.py --since "4 days ago" --repo /path/to/repo
+    python .github/skills/genome/genome-extract.py --since "7 days ago"
+    python .github/skills/genome/genome-extract.py --since "4 days ago" --repo /path/to/repo
 """
 
 import argparse

.gitignore

@@ -36,3 +36,6 @@ memories/session/
 # Environment secrets (never commit)
 .env
 
+
+# Genome Engine generated output
+.github/genome/output/*.md